Après 15 ans à titre d'évêque du diocèse de Gaspé, il a remis sa démission au Saint-Père lorsqu'il a atteint 75 ans, conformément au Code de droit canon, et elle a été acceptée le 2 juillet 2016.

Né le 21 mai 1941, à St-Joseph-de-Lauzon, Québec, Mgr Gagnon a été ordonné prêtre en 1966 pour l'archidiocèse de Québec. Le 4 décembre 1998, il a été nommé évêque auxiliaire à Québec. Nommé administrateur apostolique du diocèse de Gaspé, le 21 juillet 2001, il est nommé évêque de ce même diocèse le 15 novembre 2002.